本市には、国、県、市が指定する文化財やそれに準じる貴重な地形、地質が多く分布しています。
国指定 史跡
大村横穴群(城本町)
県指定 天然記念物
カマノクド(赤池原町)
県指定 名勝
鹿目の滝（鹿目町）
市指定 名勝
稲荷山(西間下町)
その他の地形・地質・自然現象
温泉、オパール、ソロバン玉石(桑木津留)、人吉層と人吉層の化石(植物、貝)霧、紅取山からの眺望(その他人吉西小学校、村山公園、人吉城、高塚山、大畑町などからの眺望)、河成段丘(下原田町)、四万十層群付加体(大畑町段塔)、曼荼羅川(南泉田町)、中川原、大野渓谷、照岳越(国見峠から小川沿いに人吉に下る、切通や山裾を通る道。かつて参勤交代に使われた。)
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